Definir a qualidade de uma escola apenas por um critério certamente não é a metodologia mais adequada. No entanto, sem medição não há resultado e o ENEM é certamente uma das métricas mais precisas que temos hoje em dia para definir a qualidade do ensino médio de uma escola.
Os dados são do ENEM de 2011, recém divulgados no dia 22 de novembro de 2012 pelo Inep e são portanto os dados mais atuais para 2012.
A penúltima coluna refere-se a a média de pontuação e a última coluna refere-se ao percentual de alunos que participaram da prova, que não é obrigatória.
Melhores escolas de São José – SC – ENEM 2011-2012
| Pos. | Entidade | REDE | Part. % | Nota |
| 1 | COLEGIO DOM JAIME CAMARA | Privada | 76,0 | 620,22 |
| 2 | IF-SC – CAMPUS SAO JOSE | Federal | 65,1 | 595,20 |
| 3 | COLEGIO ALPHA OBJETIVO | Privada | 68,9 | 581,41 |
| 4 | COLEGIO ELISA ANDREOLI | Privada | 64,3 | 581,06 |
| 5 | COLEGIO ENERGIA SAO JOSE | Privada | 52,1 | 559,30 |
| 6 | CENTRO EDUC BARREIROS | Privada | 50,0 | 537,26 |
| 7 | COLEGIO MERIDIANO | Privada | 57,9 | 531,37 |
| 8 | CENTRO EDUCACIONAL CENECISTA SANTA CRUZ | Privada | 61,1 | 526,54 |
