Definir a qualidade de uma escola apenas por um critério certamente não é a metodologia mais adequada. No entanto, sem medição não há resultado e o ENEM é certamente uma das métricas mais precisas que temos hoje em dia para definir a qualidade do ensino médio de uma escola.
Os dados são do ENEM de 2011, recém divulgados no dia 22 de novembro de 2012 pelo Inep e são portanto os dados mais atuais para 2012.
A penúltima coluna refere-se a a média de pontuação e a última coluna refere-se ao percentual de alunos que participaram da prova, que não é obrigatória.
Melhores escolas de Santos – ENEM 2011-2012
| Pos. | Entidade | REDE | Part. % | Nota |
| 1 | OBJETIVO DO LITORAL CENTRO EDUCACIONAL UNID II | Privada | 91,9 | 671,81 |
| 2 | COC UNIVERSITARIO DE SANTOS COLEGIO | Privada | 82,4 | 626,24 |
| 3 | OBJETIVO DO LITORAL CENTRO EDUCACIONAL UNID VI | Privada | 83,6 | 625,38 |
| 4 | JEAN PIAGET UNID II EEPG | Privada | 76,7 | 621,20 |
| 5 | UNIVERSITAS ENSINO MEDIO COLEGIO | Privada | 79,9 | 603,48 |
| 6 | CARMO COLEGIO | Privada | 75,9 | 594,82 |
| 7 | UNILUS COLEGIO | Privada | 88,1 | 590,55 |
| 8 | KENNEDY PRESIDENTE COLEGIO | Privada | 70,6 | 582,30 |
| 9 | CORACAO DE MARIA COLEGIO | Privada | 88,9 | 576,87 |
| 10 | LICEU SAO PAULO | Privada | 68,6 | 573,50 |
| 11 | STELLA MARIS COLEGIO | Privada | 76,5 | 572,66 |
| 12 | LICEU SANTISTA | Privada | 78,7 | 569,39 |
| 13 | ARISTOTELES FERREIRA ETE | Estadual | 77,9 | 565,00 |
| 14 | SAO JOSE COLEGIO | Privada | 79,4 | 563,31 |
| 15 | OBJETIVO CENTRO EDUCACIONAL DO LITORAL UNID IV | Privada | 68,4 | 551,80 |
| 16 | COLEGIO ANGLO SANTOS | Privada | 58,3 | 548,55 |
| 17 | SESI 087 CENTRO EDUCACIONAL | Privada | 67,7 | 537,79 |
| 18 | SANTA CECILIA COLEGIO | Privada | 57,0 | 535,98 |
| 19 | VERTEX COLEGIO | Privada | 84,2 | 532,81 |
| 20 | ADVENTISTA DE SANTOS COLEGIO | Privada | 61,4 | 531,99 |
| 21 | NOVOS CAMINHOS ESCOLA | Privada | 82,6 | 528,33 |
| 22 | MARZA COLEGIO INTEGRADO | Privada | 62,2 | 526,97 |
| 23 | POSITIVUS COLEGIO UNID II | Privada | 68,8 | 522,41 |
| 24 | ORDEM E PROGRESSO ESPIRITUALISTA | Privada | 71,4 | 514,81 |
| 25 | MODELO COLEGIO | Privada | 58,8 | 509,56 |
| 26 | SESI 412 CENTRO EDUCACIONAL | Privada | 73,9 | 503,99 |
| 27 | CANADA | Estadual | 50,9 | 502,70 |
| 28 | SANTISTA COLEGIO ATENEU | Privada | 51,6 | 502,34 |
| 29 | FERNANDO DE AZEVEDO PROF | Estadual | 53,8 | 492,09 |
| 30 | SUETONIO BITTENCOURT JUNIOR PROF | Estadual | 50,0 | 487,49 |
| 31 | OLGA CURY | Estadual | 50,4 | 479,71 |
| 32 | RITA DE CASSIA COLEGIO | Privada | 50,0 | 474,26 |
