Definir a qualidade de uma escola apenas por um critério certamente não é a metodologia mais adequada. No entanto, sem medição não há resultado e o ENEM é certamente uma das métricas mais precisas que temos hoje em dia para definir a qualidade do ensino médio de uma escola.
Florianópolis teve uma mudança interessante, com o Colégio Catarinense saindo da liderança e caindo para sexto. Interessante também notar que as melhores escolas de Florianópolis estão com média muito abaixo das melhores escolas nas principais capitais.
Os dados são do ENEM de 2011, recém divulgados no dia 22 de novembro de 2012 pelo Inep e são portanto os dados mais atuais para 2012.
A penúltima coluna refere-se a a média de pontuação e a última coluna refere-se ao percentual de alunos que participaram da prova, que não é obrigatória.
Melhores escolas de Florianópolis – ENEM 2011-2012
| Pos. | Entidade | REDE | Part. % | Nota |
| 1 | COLEGIO ENERGIA | Privada | 79,7 | 628,99 |
| 2 | ESCOLA AUTONOMIA-COLEGIO ITACORUBI | Privada | 64,5 | 618,40 |
| 3 | COLEGIO BOM JESUS CORACAO DE JESUS | Privada | 57,1 | 596,35 |
| 4 | EDUCANDARIO IMACULADA CONCEICAO | Privada | 71,9 | 592,97 |
| 5 | INSTITUTO FEDERAL DE EDUCACAO TECNOLOGICA DE SANTA CATARINA | Federal | 66,6 | 592,55 |
| 6 | ASAV – COLEGIO CATARINENSE | Privada | 70,9 | 591,29 |
| 7 | COLEGIO TENDENCIA | Privada | 61,3 | 590,70 |
| 8 | COLEGIO DE APLICACAO UFSC | Federal | 70,7 | 589,82 |
| 9 | COLEGIO GERACAO | Privada | 69,0 | 589,65 |
| 10 | COLEGIO ADVENTISTA DE FLORIANOPOLIS – ESTREITO | Privada | 50,0 | 580,69 |
| 11 | EEB FELICIANO NUNES PIRES | Estadual | 90,4 | 577,75 |
| 12 | COCCORREGO GRANDE | Privada | 50,0 | 568,48 |
| 13 | COLEGIO SALVATORIANO NOSSA SENHORA DE FATIMA | Privada | 72,7 | 561,83 |
| 14 | COLEGIO ESTIMOARTE | Privada | 72,4 | 551,66 |
| 15 | COLEGIO ADVENTISTA DE FLORIANOPOLIS – CENTRO | Privada | 64,7 | 539,10 |
| 16 | EPI ESCOLA DA PRAIA DOS INGLESES | Privada | 66,7 | 537,43 |
| 17 | COLEGIO ANTONIO PEIXOTO | Privada | 60,0 | 518,67 |
