Definir a qualidade de uma escola apenas por um critério certamente não é a metodologia mais adequada. No entanto, sem medição não há resultado e o ENEM é certamente uma das métricas mais precisas que temos hoje em dia para definir a qualidade do ensino médio de uma escola.

Os dados são do ENEM de 2011, recém divulgados no dia 22 de novembro de 2012 pelo Inep e são portanto os dados mais atuais para 2012.
A penúltima coluna refere-se a a média de pontuação e a última coluna refere-se ao percentual de alunos que participaram da prova, que não é obrigatória.
Melhores escolas de Manaus – ENEM 2011-2012
| Pos. | Entidade | REDE | Part. % | Nota |
| 1 | CENTRO EDUCACIONAL LATO SENSU | Privada | 75,4 | 652,26 |
| 2 | CENTRO EDUC LATO SENSU II | Privada | 72,5 | 639,04 |
| 3 | FUNDACAO NOKIA DE ENSINO | Privada | 86,7 | 631,48 |
| 4 | LAVINIENSE ENSINO INTEGRADO | Privada | 87,5 | 629,31 |
| 5 | COLEGIO MILITAR DE MANAUS | Federal | 66,9 | 595,54 |
| 6 | CENTRO EDUCACIONAL ADALBERTO VALLE – UNIDADE I | Privada | 72,0 | 586,07 |
| 7 | CENTRO LITERATUS | Privada | 72,3 | 582,75 |
| 8 | CAMPUS MANAUS-CENTRO | Federal | 77,0 | 569,75 |
| 9 | COL SANTA DOROTEIA | Privada | 78,7 | 564,09 |
| 10 | CENTRO EDUCACIONAL FUCAPI LYNALDO CAVALCANTE DE ALBUQUERQUE CEEF | Privada | 58,3 | 555,12 |
| 11 | CENTRO INTEGRADO DE EDUCACAO CHRISTUS – CIEC SUL | Privada | 68,8 | 553,16 |
| 12 | COLEGIO DO NORTE | Privada | 77,3 | 552,83 |
| 13 | CENTRO EDUCACIONAL LA SALLE | Privada | 77,2 | 549,16 |
| 14 | CENTRO METROPOLITANO DE ENSINO DO AMAZONAS CEMETRO | Privada | 82,3 | 545,22 |
| 15 | ACROPOLE INSTITUICOES EDUCACIONAIS LTDA | Privada | 69,7 | 542,07 |
| 16 | COLEGIO PRE MEDICO | Privada | 68,1 | 539,23 |
| 17 | ESCOLAS IDAAM – UNIDADE DJALMA BATISTA | Privada | 80,9 | 536,35 |
| 18 | ESC EST T INT MARCANTONIO VILACA II | Estadual | 87,9 | 532,53 |
| 19 | CENTRO EDUCACIONAL SANTA TERESINHA | Privada | 66,7 | 532,50 |
| 20 | INSTITUTO BATISTA IDA NELSON | Privada | 58,7 | 531,25 |
| 21 | COLEGIO NOSSA SENHORA AUXILIADORA | Privada | 73,8 | 529,36 |
| 22 | INSTITUTO DE EDUCACAO PROF DENIZARD RIVAIL | Privada | 66,7 | 525,65 |
| 23 | ESCOLA ESTADUAL MARCANTONIO VILACA | Estadual | 97,4 | 524,71 |
| 24 | COLEGIO MILITAR DA POLICIA MILITAR | Estadual | 82,9 | 522,76 |
| 25 | COL DOM BOSCO | Privada | 75,6 | 522,15 |
| 26 | ESCOLAS NILTON LINS | Privada | 53,6 | 520,45 |
| 27 | CENTRO EDUCACIONAL RAIMUNDO BELO FERREIRA | Privada | 74,1 | 515,95 |
| 28 | ESCOLA DE EDUCACAO BASICA E PROFISSIONAL FUNDACAO BRADESCO | Privada | 84,4 | 513,98 |
| 29 | INSTITUTO DE EDUCACAO DO AMAZONAS | Estadual | 89,4 | 503,74 |
| 30 | INSTITUTO HILDA FERREIRA | Privada | 76,7 | 499,21 |
| 31 | COLEGIO ADVENTISTA PAUL BERNARD | Privada | 53,1 | 496,35 |
| 32 | INSTITUTO ADVENTISTA DE MANAUS | Privada | 54,4 | 495,78 |
| 33 | CENTRO EDUCACIONAL ALVARO BOTELHO MAIA | Privada | 70,0 | 495,03 |
| 34 | ESCOLA CELUS LTDA | Privada | 60,0 | 491,27 |
| 35 | ESCOLA ESTADUAL SENADOR PETRONIO PORTELLA | Estadual | 89,1 | 491,09 |
| 36 | CENTRO EDUC SILVIA GUERRA | Privada | 65,0 | 489,72 |
| 37 | ESCOLA ESTADUAL DE TEMPO INTEGRAL DRA ZILDA ARNS NEUMANN | Estadual | 75,0 | 488,51 |
| 38 | COLEGIO AMAZONENSE DOM PEDRO II | Estadual | 85,3 | 488,32 |
| 39 | ESCOLA CONCORDIA DE ENSINO FUNDAMENTAL E MEDIO DA ULBRA | Privada | 51,6 | 487,36 |
| 40 | ESCOLA VOCACIONAL MASROUR | Privada | 62,8 | 486,94 |
| 41 | ESCOLA ESTADUAL MARIA AMELIA DO ESPIRITO SANTO | Estadual | 71,9 | 486,81 |
| 42 | CESF – CENTRO EDUCACIONAL SAO FRANCISCO | Privada | 81,3 | 486,28 |
| 43 | ESCOLA ESTADUAL SENADOR JOAO BOSCO RAMOS DE LIMA | Estadual | 75,1 | 484,98 |
| 44 | CENTRO EDUCACIONAL CASIMIRO DE ABREU | Privada | 58,1 | 481,12 |
| 45 | COLEGIO BRASILEIRO PEDRO SILVESTRE | Estadual | 77,9 | 478,90 |
| 46 | CENTRO EDUC ANCHIETA | Privada | 51,9 | 477,99 |
| 47 | INSTITUTO DE EDUCACAO EL SHADAY | Privada | 61,3 | 477,19 |
| 48 | ESCOLA ESTADUAL BRIG JOAO CAMARAO TELLES RIBEIRO | Estadual | 64,0 | 476,82 |
| 49 | INSTITUTO FEDERAL DE EDUCACAO CIENCIA E TECNOLOGIA DO AMAZONAS CAMPUS MANAUS – ZONA LESTE | Federal | 71,3 | 475,01 |
| 50 | ESCOLA ESTADUAL PROFESSORA ALICE SALERNO GOMES DE LIMA | Estadual | 64,2 | 473,55 |
| 51 | INSTITUTO BATISTA DO AMAZONAS | Privada | 50,0 | 470,97 |
| 52 | ESCOLA ESTADUAL MARIA RODRIGUES TAPAJOS | Estadual | 62,2 | 463,91 |
| 53 | ESCOLA ESTADUAL SOLON DE LUCENA | Estadual | 70,1 | 462,14 |
| 54 | CENTRO EDUCACIONAL RECANTO DA CRIANCA INTERATIVO | Privada | 68,4 | 459,05 |
| 55 | E E PROFESSOR FRANCISCO DAS CHAGAS DE SOUZA ALBUQUERQUE | Estadual | 61,0 | 457,66 |
| 56 | ESCOLA ESTADUAL PROFESSOR ANTENOR SARMENTO | Estadual | 52,9 | 456,57 |
| 57 | ESCOLA ESTADUAL PROF ONDINA DE PAULA RIBEIRO | Estadual | 60,1 | 456,17 |
| 58 | ESCOLA ESTADUAL PROFESSORA SEBASTIANA BRAGA | Estadual | 69,6 | 455,38 |
| 59 | CENTRO EDUCACIONAL EDUARDO RIBEIRO | Privada | 57,1 | 455,36 |
| 60 | ESCOLA ESTADUAL DE TEMPO INTEGRAL JOAO DOS SANTOS BRAGA | Estadual | 83,3 | 455,13 |
| 61 | ALDEIA DO CONHECIMENTO PROF RUTH PRESTES GONCALVES | Estadual | 66,4 | 454,38 |
| 62 | ESCOLA ESTADUAL FREI SILVIO VAGHEGGI | Estadual | 66,9 | 453,94 |
| 63 | ESCOLA ESTADUAL PROFESSOR RUY ALENCAR | Estadual | 60,3 | 453,88 |
| 64 | ESCOLA ESTADUAL RAIMUNDA HOLANDA DE SOUZA | Estadual | 51,5 | 453,74 |
| 65 | ESCOLA ESTADUAL MARCIO NERY | Estadual | 61,5 | 452,17 |
| 66 | ESCOLA ESTADUAL ANTONIO DE LUCENA BITTENCOURT | Estadual | 69,7 | 450,75 |
| 67 | ESCOLA ESTADUAL PROF ADELAIDE TAVARES DE MACEDO | Estadual | 63,0 | 450,33 |
| 68 | ESCOLA ESTADUAL PRESIDENTE CASTELO BRANCO | Estadual | 51,3 | 449,55 |
| 69 | ESCOLA ESTADUAL JOAO BOSCO PANTOJA EVANGELISTA | Estadual | 61,6 | 447,15 |
| 70 | ESCOLA ESTADUAL SENADOR MANUEL SEVERIANO NUNES | Estadual | 71,9 | 446,83 |
| 71 | ESCOLA ESTADUAL SANT ANA | Estadual | 66,1 | 445,62 |
| 72 | ESCOLA ESTADUAL FARIAS BRITO | Estadual | 70,1 | 442,78 |
| 73 | ESCOLA ESTADUAL PROF ANTONIO MAURITY MONTEIRO COELHO | Estadual | 53,7 | 442,57 |
| 74 | ESCOLA ESTADUAL DR ISAAC SVERNER | Estadual | 55,2 | 440,63 |
| 75 | ESCOLA ESTADUAL ERNESTO PENAFORT | Estadual | 57,7 | 440,51 |
| 76 | ESCOLA ESTADUAL NOSSA SENHORA APARECIDA | Estadual | 60,6 | 440,08 |
| 77 | ESCOLA ESTADUAL DEP JOSUE CLAUDIO DE SOUZA | Estadual | 59,5 | 439,75 |
| 78 | ESCOLA ESTADUAL LIBERALINA WEILL | Estadual | 77,9 | 439,65 |
| 79 | ESCOLA ESTADUAL MARIA DO CEU VAZ D OLIVEIRA | Estadual | 51,4 | 439,19 |
| 80 | ESCOLA ESTADUAL RUY ARAUJO | Estadual | 58,8 | 438,34 |
| 81 | ESCOLA ESTADUAL PROF EUNICE SERRANO TELLES DE SOUZA | Estadual | 53,0 | 437,70 |
| 82 | ESCOLA ESTADUAL DOM MILTON CORREA PEREIRA | Estadual | 52,4 | 435,59 |
| 83 | ESCOLA ESTADUAL DAISAKU IKEDA | Estadual | 52,2 | 435,23 |
| 84 | ESCOLA ESTADUAL PRIMEIRO DE MAIO | Estadual | 50,0 | 435,19 |
| 85 | ESCOLA ESTADUAL TIRADENTES | Estadual | 58,4 | 434,15 |
| 86 | ESCOLA ESTADUAL ALMIRANTE ERNESTO MELLO BAPTISTA | Estadual | 63,3 | 434,14 |
| 87 | ESCOLA ESTADUAL BENJAMIN MAGALHAES BRANDAO | Estadual | 64,6 | 433,21 |
| 88 | ESCOLA ESTADUAL PRO JORGE KARAM NETO | Estadual | 50,5 | 429,23 |