Definir a qualidade de uma escola apenas por um critério certamente não é a metodologia mais adequada. No entanto, sem medição não há resultado e o ENEM é certamente uma das métricas mais precisas que temos hoje em dia para definir a qualidade do ensino médio de uma escola.

Os dados são do ENEM de 2011, recém divulgados no dia 22 de novembro de 2012 pelo Inep e são portanto os dados mais atuais para 2012.
A penúltima coluna refere-se a a média de pontuação e a última coluna refere-se ao percentual de alunos que participaram da prova, que não é obrigatória.
Melhores escolas de Natal – ENEM 2011-2012
Pos. | Entidade | REDE | Part. % | Nota |
1 | COLEGIO CIENCIAS APLICADAS | Privada | 80,3 | 647,91 |
2 | CENTRO DE EDUCACAO INTEGRADA LTDA – MATRIZ | Privada | 75,2 | 641,23 |
3 | CENTRO DE EDUCACAO INTEGRADA MAIS LTDA | Privada | 80,6 | 621,92 |
4 | INSTITUTO FEDERAL DE EDUCACAO CIENCIA E TECNOLOGIA DO RN – IFRN – CAMPUS AVANCADO DA CIDADE ALTA | Federal | 60,8 | 603,47 |
5 | COLEGIO SALESIANO SAO JOSE | Privada | 73,7 | 598,48 |
6 | COLEGIO MARISTA DE NATAL | Privada | 59,6 | 596,56 |
7 | COLEGIO NOSSA SENHORA DAS NEVES | Privada | 74,5 | 594,61 |
8 | OVERDOSE COLEGIO E CURSO | Privada | 71,6 | 590,26 |
9 | COMPLEXO EDUC HENRIQUE CASTRICIANO | Privada | 70,2 | 581,48 |
10 | COMPLEXO EDUCACIONAL CONTEMPORANEO | Privada | 76,7 | 577,21 |
11 | ESCOLA DOMESTICA DE NATAL | Privada | 70,8 | 567,65 |
12 | INSTITUTO BRASIL | Privada | 80,6 | 561,36 |
13 | ITAECE COMPLEXO EDUCACIONAL – ICE | Privada | 88,2 | 558,41 |
14 | COLEGIO BEREIANO | Privada | 78,9 | 557,13 |
15 | CENTRO EDUCACIONAL MARISTELLA | Privada | 81,0 | 556,25 |
16 | INSTITUTO REIS MAGOS | Privada | 74,3 | 553,02 |
17 | PIAGET COLEGIO E CURSO | Privada | 62,5 | 552,22 |
18 | FACEX | Privada | 68,4 | 550,60 |
19 | MUNDIAL COLEGIO E CURSO LTDA | Privada | 84,0 | 547,36 |
20 | COLEGIO DEGRAUS DO SABER | Privada | 57,1 | 537,86 |
21 | CDF COLEGIO E CURSO | Privada | 67,9 | 537,85 |
22 | INSTITUTO MARIA AUXILIADORA | Privada | 67,6 | 533,81 |
23 | CENTRO EDUCACIONAL SANTO AGOSTINHO | Privada | 65,9 | 530,12 |
24 | CDF COLEGIO E CURSO | Privada | 69,2 | 523,90 |
25 | COLEGIO ENCANTO UNIDADE I | Privada | 56,8 | 518,32 |
26 | COLEGIO OBJETIVO DE NATAL | Privada | 60,9 | 517,33 |
27 | IMPACTO COLEGIO E CURSO | Privada | 65,6 | 515,35 |
28 | SOCIEDADE EDUCATIVA ZONA SUL LTDA | Privada | 71,4 | 511,55 |
29 | INSTITUTO SAGRADA FAMILIA | Privada | 74,6 | 504,79 |
30 | COLEGIO IMACULADA CONCEICAO | Privada | 65,9 | 504,28 |
31 | COLEGIO HIPOCRATES ZONA NORTE | Privada | 69,7 | 498,81 |
32 | ESCOLA DE EDUC BASICA E PROFISSIONAL FUND BRADESCO | Privada | 76,5 | 496,74 |
33 | ESCOLA MARISTA CHAMPAGNAT DE NATAL | Privada | 59,0 | 496,42 |
34 | EXITO COLEGIO E CURSO | Privada | 62,2 | 483,99 |
35 | ESC EST PROF EDGAR BARBOSA ENS 2 GRAU | Estadual | 56,8 | 482,41 |
36 | COLEGIO ENCANTO UNIDADE II | Privada | 54,5 | 482,28 |
37 | CENTRO DE REFERENCIA EDUCACIONAL LTDA ME | Privada | 63,2 | 481,36 |
38 | ESCOLA ESTADUAL SEBASTIAO FERNANDES DE OLIVEIRA | Estadual | 67,3 | 479,62 |
39 | ESC EST JERONIMO GUEIROS ENS FUND E MEDIO | Estadual | 57,1 | 479,54 |
40 | INTELECTUAL COLEGIO E CURSO | Privada | 57,1 | 471,88 |
41 | ESC EST DES F CAVALCANTI ENS 1 E 2 GRAUS | Estadual | 51,0 | 468,40 |
42 | ESC EST FERREIRA ITAJUBA ENS FUNDAMENTAL E MEDIO | Estadual | 59,5 | 467,19 |